Erkeklerde HPV belirtileri genel olarak cinsel organda siğil ya da benzeri lezyonlar biçiminde ortaya çıkar. Çoğu erkek bu enfeksiyonu fark etmez çünkü belirtileri çok hafif olabilir veya hiçbir belirti vermez. Çoğunlukla cinsel birliktelik ile bulaşır. Belirtileri arasında genel olarak kaşıntı, yanma, ağrı veya akıntı görülür. 

Erkeklerde HPV, özellikle ergenlik dönemi içerisinde başlayan cinsel birliktelikler, ilişkiye girilen partner sayısının fazla olması, korunma yöntemleri kullanılmadan cinsel birliktelik yaşamak, farklı bir cinsel hastalığa sahip olmak, bağışıklık sistemini düşüren herhangi bir hastalık geçirmek gibi faktörler virüsü etkin duruma getirir. HPV virüsünden korunmak için ilk önlemler, cinsel ilişki sırasında korunmaktır.