HPV’den korunmak için en etkili yöntemlerden biri HPV aşısıdır. Aşı virüsün neden olduğu enfeksiyonların etkinliğini azaltarak koruyucu etki gösterir. Genç kızlar ve erkekler için önerilir. Kadınlar için henüz cinsel hayatı başlamadan uygulanan aşı, etkili sonuç verir. Cinsel ilişki ile bulaşan virüse karşı etkilidir. 

HPV’den Korunmak, cinsel ilişki sırasından kondom kullanmak HPV ve farklı cinsel yolla bulaşan enfeksiyonlardan korur. Ancak kullanılan kondom, genital bölgeyi tam olarak kapatmadığı için virüse karşı %100 koruma sağlamaz. Düzenli olarak uygulanan tarama testleri, smear testi yaptırmak ve kontrolleri yaptırmak önemlidir.